继续延续(xù )(🔨)上一季的剧情，原来(🐌)穆(mù )(🍩)德(dé )受了骗，及时发觉错误后和史(🎺)考(🔧)莉(lì )串(🎹)通(🆖)好(hǎo )来(lái )骗政府(fǔ )高层(🏴)，以(yǐ )(🐮)潜(🥩)入一(😧)个“作为一个(gè )(🎲)普通(❣)FBI特别探员(🖲)不该进(jìn )入的地方”搜集需要(yào )的(👁)资料(liào )。本季发(🛹)展越(yuè )来越(yuè )精彩(cǎi )，一些没有被完全改(gǎi )造的混血外星人(🕕)联(lián )合(😱)起来(lái )抵(dǐ )抗(💞)殖(⏺)民阴谋(móu )。史考(kǎo )莉(lì )被绑(bǎng )架时子宫被(bèi )移(🔢)除，但(dàn )今年(🎛)却出(chū )现了(🥔)她的孩(🙂)子——艾蜜(mì )莉。今(jīn )年(🌞)制(zhì )(🙄)作(zuò )小组甚至(💪)找了两位知名科幻小(xiǎo )说家操笔，客(⛳)串(😍)写出两集剧本(🎋)。另外今年也有(🤖)一集喜剧。整出X档案为了配合电影(yǐng )的上映，加(jiā )(😊)入了一些(xiē )角色及内容，“辛迪加(🌼)”组(💹)织(zhī )的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事(shì )实的真(💏)相。穆德前(qián )女友的出(🍽)现也对穆德(dé )与史考(kǎo )莉(lì )间的关系做出重大(dà )考验。该季结束于吸(👛)烟人烧毁(huǐ )了所(🚻)有X档案(àn )卷(🛃)宗。