晴朗时(shí )节(jiē )，江户(✒)川(chuān )柯南（高山南 配(🌰)音）和毛利小五郎(láng )（小(xiǎo )山(shān )力也 配音）、(🐉)小兰(🌰)（山(🔬)崎和(🗼)佳奈(🥩) 配音）(📿)以及少年侦(zhēn )探团的伙(huǒ )伴们(men )一同来(lái )到京(🕔)都，他(🎩)们(men )即(🗄)将(🛍)登上(🕖)自卫队(duì )(🙍)的宙斯盾战(zhàn )舰(jiàn )，体验一把出海作战的感觉，期(🙁)间还结(jié )识了美丽(lì )又有着几分神秘的女(nǚ )(🌙)自(zì )(📎)卫队员藤井七(📯)海（柴咲幸 配音）。谁知快(kuài )乐的氛围很快被恐慌(🐑)所(🏂)替代(dài )，战舰上(㊙)突(tū )(👓)然(🙀)发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐(kǒng )慌与猜(cāi )测。原来某(mǒu )国神秘间谍(dié )X已悄悄登上宙斯盾(👊)，伺机(jī )盗(dào )取战(😊)舰上的(de )绝密情(⛏)报。
　(🚶)　为(wéi )了找出(😝)隐(yǐn )藏的对(💿)手，柯(🈺)南和灰(🔍)原哀（(⏲)林(lín )(📛)原(yuán )惠(huì )美 配音）、阿笠博(bó )士（绪方(fāng )贤一 配音）、(👄)服(🐖)部(🆙)平次(🔫)（堀(🔥)川亮 配音）以及(jí )远山和叶（宫村优子 配(pèi )音）通力合作，与间(📬)谍展(🕺)开连番斗(🚤)智(zhì )斗勇(⛴)的较量……