21世纪初，人类将多(duō )数人留(🐌)在被哥斯拉(lā )蹂躏(🕟)的(de )地(dì )球上，仅使被选中的人(🆖)们乘(chéng )上恒(🌰)星间移(🏴)民(mín )船(chuán )·(🥩)阿拉特拉(📿)姆，前往能够(❣)移(🌗)居的“约定之地(⚫)·τ(🕔)星e”。但这一计(jì )划(huá )失(shī )败，人类只得(dé )再度(🏐)返回地(dì )球(🛺)。而长(🎫)距离亚空(🍮)间航行(😻)所引(yǐn )发的时(🥀)空歪曲，导(🤷)致(🔊)人类(⏺)回到的地(dì )方变成了“两万年后的地(dì )球”。在这个(gè )地球，主人公·晴男等人在遭(🤠)受哥斯拉(㊙)袭击(jī )的同时，与埃克西弗、比尔沙(🔔)尔(ěr )德两(🕙)种族的(💠)异星(xīng )人共同实行谋(móu )划(huá )了20年的(de )“对哥斯拉(🈁)战(zhàn )(❕)术”，通过殊(shū )死(sǐ )战(zhàn )斗(dòu )成(chéng )功击(🦇)倒了哥斯拉。
　　但(🌼)喜悦并未(wèi )持续多久，深(shēn )藏(cáng )地(dì )下的真正哥(gē )斯拉“哥斯拉·地球”现身了(le )(🥅)。两万(wàn )年间持续(📐)成长生(shēng )存、身高300米、质(🌸)量超过(guò )10万(🍁)吨，在进化成(chéng )这(zhè )种姿(🍺)态的超(chāo )(👚)巨大哥(gē )斯拉压倒性的破(pò )坏力面前，晴男等人落(luò )花流水。
　　拯救了晴男的(💛)是(shì )被视为人类的残存者“弗图(tú )亚”之民，米(mǐ )亚娜。弗图亚是他(tā )们在(zài )(⛎)这个(gè )(🍝)地球(qiú )首(🕌)次(🏗)遇到的人型生(shēng )命种族。他们(⏭)会(huì )是人(🤠)类(🐑)的子(😂)孙吗——。“弗图亚的(de )神也被哥斯拉击(🦄)破(pò )，如今只剩下卵。挑(🌮)战(👎)者(❗)、抗争者，全部被火焰吞噬而(🏺)消(🥈)失(shī )了”面对这(🥖)样(⛄)的他(🤫)们(😕)，晴男(💽)回应(🌄)道(dào )“这(😯)是以人(🕠)类的双手夺(💦)回地球的最后机会了(🧖)”。
　　另(🚞)一(yī )方面，比尔沙尔德的指挥官·加尔(🍩)格，注(Ⓜ)意到弗图(📧)亚使用(yòng )的箭(🐎)头(tóu )是(🏥)由“自(zì )律思(🙎)考金属体·纳米金属”所制造而(ér )(🈹)欢(huān )喜。这(zhè )和(hé )21世(🛳)纪(jì )他们(men )在(zài )富士山麓作为“对哥斯(🔷)拉决(jué )战兵器(qì )”所开发(fā )、在启动前遭到(dào )破坏的“机(jī )械哥斯拉”由同种(⤴)物(🤮)质所(suǒ )构成。这(zhè )(📑)正是(shì )(🔝)当时的(de )开发(fā )设(🐩)备至今(☕)仍然残存的(💦)证明——。