位于东(dōng )京西部的巨大“学园(yuán )(🏽)都(🐌)市”。在总人口(🕟)达230万人(rén )，其中约8成是学(xué )生的(🌰)这座(🔬)都市中，实施着超能力开(kāi )发(fā )的(🎏)特殊课程，学生(🚤)们的能力被给予从(cóng )(🤷)“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六(🙁)阶段评价(🚑)。
　　高(gāo )(⏺)中生上条当(dāng )麻，也(yě )是住在学园都市(shì )的学生之一(yī )。他由于隐(yǐn )藏在右(yòu )手中(✋)的(🐑)力量(🙌)——只(🌞)要是异能(néng )之(🙉)力，就连神的加(⛏)护都能消除的“幻想杀(😍)手Imagine Breaker”，而被评(píng )价为(wéi )(💹)名(míng )落(luò )孙(🥊)山的“无能力”，过着充满不幸的人生。
　　而上条的学生(shēng )生活，由于暑(🔍)假开始时从天而降的纯(🔷)白修(xiū )(♌)女(nǚ )而发生了巨(🔞)大的(🚲)变化(huà )。自从与逃(🐖)离(lí )“魔法(fǎ )”世(🚡)界(jiè )的(de )她——“禁(🍁)书目(mù )录茵蒂克丝(📤)”相遇开始，上条就被卷入(❓)了各(✖)种各(💑)样(yàng )的(😉)事件(🚩)中。统率(❄)学园都市的“科学(🐈)”方、与(🌲)茵蒂克丝关联的“魔(mó )法(fǎ )”方，在惊险地解决(🍾)双方事件(📯)的(de )过程中，他的人(rén )际关系也逐(⛎)步扩(🍝)展。之后，魔(😼)法(🔮)一方(fāng )的十字教最大宗派罗马(🤠)正教，终于注意到(🕤)上条的(🖥)存(cún )在(zài )(🌲)……。
　　如(🌸)同(tóng )呼应(yīng )魔(mó )法方(👎)一般，科学方的学园都(🛫)市(shì )(📛)也(yě )有所动作(🦀)。但也有(💘)与逐渐开始对立的(de )世界动(🔭)向抗(kàng )争的人不断出现。那(nà )些通过与上条有(yǒu )所关联，而使命运大为改变的(de )“英(yīng )雄”们。
　　他们挺身而出(chū )与(☔)世(shì )界对峙。如(rú )同上(🏥)条当(dāng )麻做过(guò )(🙎)的(📦)那样。
　　(🚰)科(💻)学与魔法(fǎ )第三次交(jiāo )织(zhī )(🛳)之时(shí )，故(🌔)事(shì )将大幅推进(🏺)！！