位于东京(jīng )西部的巨(jù )(🐽)大“学园都(dōu )市(shì )”。在总人口达230万(wàn )人，其中(zhōng )约8成是学生的这座都市中，实(💤)施着(zhe )超能力开(kāi )发(fā )的特(tè )殊课程(chéng )，学(😎)生们的能力被给予(yǔ )从(cóng )“无能力Level 0”到“超(chāo )能(néng )(🐖)力Level 5”的六阶段评(🖍)价。
　　高(gāo )中生(🌙)上条当麻(má )，也是住在学(⏯)园都市的学(💱)生之一(yī )。他由(🥎)于隐藏在右手中的力量——只(🌞)要是异(👓)能(🙀)之力，就(jiù )连神(shén )的加护都(dōu )能消除的(🚻)“幻(🕙)想杀手Imagine Breaker”，而被(bèi )评价为名落孙(sūn )(🥊)山(🍑)的“无能力(lì )”，过着充(🏻)满不幸的人生。
　(📟)　(🐩)而(💯)上条的学生(shēng )(💿)生(🎥)活，由于暑假开(🤥)始时从天而(💏)降的纯(chún )白修女而发生了(🏃)巨大的变(📐)化(huà )。自从与逃离“魔法”世(shì )界的她—(🏓)—“禁书目录茵蒂(👗)克丝(sī )”相(xiàng )遇开始，上(shàng )(⏺)条就被卷入了各种各(gè )样的事件中。统率(❄)学园(yuán )都市的“科学(xué )”方、与茵(💕)蒂克(🚪)丝关联的(de )“魔(😲)法”方，在惊险地解(🛌)决双方(fāng )事件的(de )过程中，他的人(🏆)际关系也逐步扩展。之(🕌)后，魔法(fǎ )一方(♟)的十(shí )(🦐)字教最(zuì )大宗派罗马正(zhèng )教，终于注意(yì )到(🕤)上(⛱)条的存在……。
　　(🏉)如同呼(hū )(🍐)应魔(🧔)法方一(❗)般(bān )，科学方的(de )(🤳)学(🔡)园(yuán )都市(📛)也(yě )有所动作。但(dàn )也有与逐(zhú )渐(📒)开始对(🎛)立(🍆)的(💽)世界动(🔭)向(xiàng )抗(kàng )争的(de )(😫)人不断出(chū )(🤟)现。那(😫)些通过(guò )与上条有所(🧖)关联，而使命运大为改变(biàn )的“英雄”们。
　　他(tā )们挺(tǐng )身(shēn )而出与世界对峙。如同上条当麻(🍑)做过的那(😋)样。
　　(🚰)科学与魔法第三(🎦)次交织之(🤺)时，故(🌔)事将大幅推进(🏺)！！