位于东(dōng )京西部的(de )(✒)巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其(qí )中(zhōng )约8成(🆖)是学生的这座(zuò )都市(🗼)中(🐮)，实施着(zhe )超(📿)能力(👋)开发的特(❣)殊课(🏇)程，学生们(🖲)的(⚫)能力(lì )被给(gěi )予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的(✖)六阶段评价。
　　高(⏺)中生上(shàng )条当(dāng )麻(🔩)，也是住(zhù )在(🛑)学园都市的学生之(🌑)一。他由于隐藏在右手中(zhōng )的力量—(🤠)—只要是(shì )异(yì )(👓)能之力，就连(lián )神的(de )加护都能消除的(🚻)“幻想(xiǎng )杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的(👊)“无能(néng )(🚗)力”，过(🈸)着充(chōng )满不(bú )幸(⛏)的(de )(🐨)人(rén )生(🥋)。
　　而上(shàng )条的学生生活，由于暑假(jiǎ )开(kāi )始时从天而降(jiàng )(📸)的纯(chún )白修女(💸)而发生了巨大的变化。自从(🌱)与逃离(lí )(🆙)“魔(🔫)法”世(shì )界的她——“禁书目(👛)录茵蒂克丝”相(🍺)遇(🔪)开始，上(shàng )(⏺)条就被卷入(❓)了各种(🕺)各样(yàng )的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝(🐌)关(🐱)联(lián )的“魔法(🐅)”方，在(💨)惊险地解决双方事件的过程中，他(tā )的(de )人际关系(xì )也(🎆)逐步(bù )扩展。之(zhī )(🕌)后(🏗)，魔(mó )法一(yī )(🈺)方的十字教(🍏)最大(dà )宗派罗(luó )马正(zhèng )教(🖥)，终于注意(🐼)到上(⛱)条(🥈)的存在……。
　(🍂)　如(🌸)同呼应魔(mó )法(fǎ )(🌮)方一(yī )般(bān )，科学方的学园都(dōu )(🛫)市也有所动作。但也(yě )(🤙)有(yǒu )与逐(zhú )渐(jiàn )开始对立(🍆)的世界动(🔭)向抗争(zhēng )(🆕)的人不断出现。那些通(🌟)过与上条有所关(guān )联，而使命(🤬)运大(👉)为改变的“英(🥡)雄”们。
　　他(tā )们挺身(shēn )而出与世界(jiè )对峙(🚄)。如同上条当(dāng )麻做过的那样。
　　科学与魔法第三次交(🐞)织之(zhī )时(shí )，故事将大幅(🔉)推进！！